Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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