Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LSAMPQ13449 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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