Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HSPB3Q12988 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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