Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CDH17Q12864 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CDH17Q12864 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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CDH17Q12864 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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CDH17Q12864 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDH17Q12864 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CDH17Q12864 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH17Q12864 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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