Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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IFFO1Q0D2I5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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