Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP7AQ04656 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms