Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NHLH2Q02577 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms