Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms