Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMAN1P49257 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms