Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDSP20132 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SDSP20132 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SDSP20132 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms