Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ITGA4P13612 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms