Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms