Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms