Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRCH4O75427 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms