Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA2O43364 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms