Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms