Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SYBU-222ENST00000529175 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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