Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KNCNA6PVL3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms