Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms