Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTAGE9A4FU28 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms