Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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