Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PLXND1Q9Y4D7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms