Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms