Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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