Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSEQ9UL01 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms