Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms