Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF275Q9NSD4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms