Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRDM12Q9H4Q4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms