Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPERQ9BY12 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPERQ9BY12 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPERQ9BY12 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPERQ9BY12 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPERQ9BY12 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms