Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUSC1Q9BVN2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms