Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR49Q8IV35 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms