Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC8DQ7L1W4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8DQ7L1W4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms