Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C15orf39Q6ZRI6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms