Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC27A3Q5K4L6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms