Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDB1Q16531 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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DDB1Q16531 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDB1Q16531 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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DDB1Q16531 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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