Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms