Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms