Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms