Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIP13Q15645 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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