Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms