Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DDX39BQ13838 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DDX39BQ13838 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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