Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms