Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms