Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PLOD1Q02809 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms