Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms