Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms