Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COG7P83436 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COG7P83436 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COG7P83436 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COG7P83436 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COG7P83436 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COG7P83436 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms