Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTRA4P83105 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms