Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRX4P78413 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IRX4P78413 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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