Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms